De stad ligt in een actief gebied van vulkanen en aardbevingen.
Arequipa wordt gedomineerd door 3 grote vulkanen: de Misti, de Chachani en de Pichu Pichu.
In 1600 is de stad totaal verwoest geweest door een uitbarsting van de Huaynaputina.
Grote aardbevingen hebben plaatsgevonden in 1687, 1868, 1958, 1960 en in 2001.
Om deze redenen vindt men voornamelijk laagbouw in de stad.
"Arequipa, de stad waar de maan vergeten is de stad met zich mee te nemen toen hij zich losmaakte van de aarde".